Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubtd1Q91WB7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubtd1Q91WB7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms