Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csde1Q91W50 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csde1Q91W50 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms