Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd248Q91V98 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd248Q91V98 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms