Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms