Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4cQ8VCD7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms