Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc9Q8VC31 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc9Q8VC31 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms