Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ApobrQ8VBT6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ApobrQ8VBT6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms