Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mterf3Q8R3J4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf3Q8R3J4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms