Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms