Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hecw1Q8K4P8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hecw1Q8K4P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms