Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f2Q8K3M1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms