Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OptnQ8K3K8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms