Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ssh3Q8K330 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Ssh3Q8K330 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ssh3Q8K330 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ssh3Q8K330 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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