Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shtn1Q8K2Q9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms