Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc12Q8K2L8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc12Q8K2L8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms