Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Depp1Q8K2F3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms