Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nek9Q8K1R7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nek9Q8K1R7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nek9Q8K1R7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms