Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Glis1Q8K1M4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Glis1Q8K1M4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Glis1Q8K1M4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms