Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700001C19RikQ8K168 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms