Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d23Q8K0F1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tbc1d23Q8K0F1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tbc1d23Q8K0F1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d23Q8K0F1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d23Q8K0F1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d23Q8K0F1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d23Q8K0F1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms