Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scamp1Q8K021 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scamp1Q8K021 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms