Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc4a8Q8JZR6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc4a8Q8JZR6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc4a8Q8JZR6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms