Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klre1Q8CJC7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klre1Q8CJC7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms