Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Znf628Q8CJ78 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Znf628Q8CJ78 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Znf628Q8CJ78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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