Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE4

Parp10, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp10Q8CIE4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp10Q8CIE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp10Q8CIE4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms