Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp1Q8CG19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp1Q8CG19 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ltbp1Q8CG19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ltbp1Q8CG19 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ltbp1Q8CG19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms