Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Parp11Q8CFF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms