Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klf17Q8CFA7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms