Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms