Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc87Q8CDL9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc87Q8CDL9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc87Q8CDL9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms