Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD26

Slc35e1, Solute carrier family 35 member E1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e1Q8CD26 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc35e1Q8CD26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc35e1Q8CD26 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms