Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riox2Q8CD15 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms