Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nhsl1Q8CAF4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nhsl1Q8CAF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms