Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8C708 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8C708 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8C708 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8C708 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8C708 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8C708 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8C708 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8C708 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.7 ms