Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strip1Q8C079 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Strip1Q8C079 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Strip1Q8C079 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms