Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rbbp5Q8BX09 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms