Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdsp2Q8BX07 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctdsp2Q8BX07 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms