Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Usp38Q8BW70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Usp38Q8BW70 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Usp38Q8BW70 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Usp38Q8BW70 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp38Q8BW70 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Usp38Q8BW70 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Usp38Q8BW70 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp38Q8BW70 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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