Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc12Q8BW49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms