Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Catsper4Q8BVN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Catsper4Q8BVN3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Catsper4Q8BVN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Catsper4Q8BVN3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Catsper4Q8BVN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms