Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmod1Q8BVA4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod1Q8BVA4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms