Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130116L18RikQ8BMV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms