Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smarcal1Q8BJL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms