Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prox2Q8BII1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prox2Q8BII1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms