Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af1l4Q8BGJ9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af1l4Q8BGJ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms