Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pknox2Q8BG99 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pknox2Q8BG99 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms