Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sestd1Q80UK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sestd1Q80UK0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms