Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc22a20Q80UJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a20Q80UJ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms