Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cul9Q80TT8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul9Q80TT8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul9Q80TT8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms