Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

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Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NischQ80TM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NischQ80TM9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NischQ80TM9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
NischQ80TM9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms